診斷生殖器念珠菌病的臨床癥狀表現多種多樣，因而診斷應根據相應臨床特點并結合真菌學檢查。只有鏡檢看到大量芽孢子、假菌絲或菌絲時，才能說明該菌處于致病狀態。必要時做病理檢查。
1.外陰陰道念珠菌病有外陰瘙癢、灼痛，陰道分泌物增多，尿痛、陰道內疼痛或刺激感，和淺表性性交痛。外陰瘙癢是最常見的癥狀，幾乎見于所有有癥狀患者，輕重不一。典型的陰道分泌物為白色凝乳狀或豆渣樣，但也可呈水樣或均勻黏稠狀2.念珠菌性包皮龜頭炎包皮及龜頭出現彌漫性潮紅、干燥光滑，包皮內側及冠狀溝處有紅色小丘疹或白色奶酪樣斑片，尿道口舟狀窩受累時可出現尿頻、尿痛。

1.外陰陰道念珠菌病3%碳酸氫鈉溶液沖洗外陰陰道或1:5000龍膽紫溶液灌注陰道。陰道炎可局部使用制霉菌素栓劑或咪唑類抗真菌藥栓劑如克霉唑、咪康唑、益康唑、布康唑。外陰炎可外涂咪唑類抗真菌制劑，如克霉唑霜、咪康唑霜、益康唑霜、酮康唑霜或聯苯芐唑霜等。
2.念珠菌性包皮龜頭炎用生理鹽水或0.1%雷佛奴爾溶液沖洗皮損處，沖洗后外涂1%~2%龍膽紫液或上述咪唑類霜劑。包皮過長者治愈后應做包皮環切術以防復發。并發尿道炎者可內服酮康唑、氟康唑或曲康唑。